防风种子的病防治：主要危害叶片和嫩茎，发病初期在叶片及嫩茎上产生白色近圆形的点状斑，中药防风，以后逐渐蔓延，全叶及嫩茎被状物覆盖。发病严重时，引起早期落叶及嫩茎枯死。此病是一种真菌性病害，病菌以闭囊壳在病株残体上越冬。翌年春温湿度条件适宜时释放出子囊孢子，从表皮直接侵入引起初侵染。发病植株上产生的分子孢子，防风种子培育，通过风雨传播，进行频繁的重复侵染。
防治方法：⑴农业防治。加强田间管理，秋冬季及时清除病残体可减少越冬菌源，注意田间通风透光。⑵药剂防治。在发病初期，喷施40%氟硅唑悬浮剂1万倍液、12.5%志信星可湿性500倍液，2-3次。
防风的斑枯病防治：主要危害叶片，茎秆也可受害。叶片染病病斑生在叶两面，圆形至近圆形，芜湖防风，大小2-5毫米，褐色，中央色稍浅，上生黑色小粒点，即病原菌分生孢子器。该病是真菌性病害，病菌以分生孢子器在病叶或病茎上越冬，翌春分生孢子借气流传播，引起初侵染和再侵染。
防治措施：⑴农业防治。合理密植，注意通风透气；科学肥水管理，提高植株抗病力；入冬前清洁田园，烧掉病残体，减少菌源。⑵药剂防治。发病初期可摘除病叶，防风采购，喷洒1:1:100的波尔多液，或50%多菌灵可湿性500倍液，或75%百菌清可湿性600倍液，或70%代森锰锌可湿性800倍液等药剂，视病情喷2-3次，间隔7-10天，以防扩大。
防风采收加工：冬季在10月下旬至11月中旬或春季在萌芽前采收。用种子繁殖的防风，第二年就可收获。春季分根繁殖的防风，在水肥充足、生长茂盛的条件下，当根长30厘米、粗1.5厘米以上时，当年即可采收。秋播的于翌年10-11月采收。采收时须从畦一端开深沟，按顺序挖掘，根挖出后除去残留茎和泥土。每亩可收干品药材200-300千克。
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